El puerto de Kos ha servido como punto de partida para viajes por el Egeo desde el siglo IV a. C., cuando las galeras mercantes transportaban ánforas de vino y cerámica a Rodas y las Cícladas.
Hoy en día, las mismas aguas turquesas albergan una flota de lanchas rápidas privadas, yates a motor y veleros personalizados disponibles para alquiler por horas o itinerarios de un día completo de salto entre islas. El muelle este del puerto gestiona los ferris comerciales; el puerto deportivo oeste, protegido por un rompeolas veneciano reconstruido en 1514, es donde parten los viajes en barco privados entre abril y octubre.
Los viajes en barco privados en Kos van desde embarcaciones compactas Compass 150cc —lanchas de fibra de vidrio con motores fuera de borda de 30 caballos de fuerza— hasta cruceros de lujo de doce metros equipados con asientos de salón, plataformas de baño y navegación por GPS. Las tarifas de alquiler por hora para lanchas rápidas autoguiadas comienzan en ochenta euros; los tours de salto entre islas con patrón a Pserimos y Plati cuestan entre doscientos y cuatrocientos euros por embarcación, dependiendo del tamaño del grupo y el servicio a bordo. La mayoría de los operadores atracan en los muelles flotantes del puerto deportivo oeste, identificables por la fila de banderas de alquiler azules y blancas que bordean el muelle.
El archipiélago del Dodecaneso ofrece más de doscientas islas dentro de un radio de navegación de tres horas desde Kos, aunque solo cuarenta y siete están habitadas durante todo el año. Los chárteres privados suelen seguir la ruta norte hacia Kalymnos y Telendos, donde los acantilados de piedra caliza caen verticalmente hacia profundidades de agua que superan los cien metros, o la ruta sur hacia Nisyros, una isla volcánica activa cuya caldera entró en erupción por última vez en 1888. Pserimos, un islote de baja altitud a cuarenta minutos al noreste del puerto de Kos, mantiene una población permanente de doce personas y recibe menos de cincuenta visitantes diarios fuera de los meses pico de verano. Su única taberna, Manolis, sirve pulpo a la parrilla pescado esa misma mañana.
Los itinerarios personalizados permiten a los viajeros anclar en calas aisladas inaccesibles por carretera: la bahía de Limnionas en la costa sur, las playas de guijarros blancos de la bahía de Kefalos, los bajíos turquesas frente a la isla de Agios Stefanos. La mayoría de los tours en barco privados incluyen equipo de snorkel, cañas de pescar y almacenamiento refrigerado para provisiones. Los espacios de salida desde el puerto de Kos se llenan rápidamente entre junio y septiembre; la reserva anticipada asegura el tipo de embarcación preferido y la disponibilidad del capitán.
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